در مراتب علمی حضرت آیت‌الله سیدجواد خامنه‌ای(ره) همین بس که ایشان از سه مرجع عظیم‌الشأن در نجف اشرف یعنی حضرات آیات عظام: میرزا محمدحسین نائینی، سیدابوالحسن اصفهانی، شیخ محمدحسین غروی اصفهانی (مشهور به کمپانی) اجازات اجتهادی خود را دریافت کرد.

مرتضی نجفی قدسی  به مناسبت رحلت آیت الله سید جواد خامنه ای، پدر گرامی رهبر معظم انقلاب آورده است:

امروزه بمباران تبلیغاتی دشمنان بسیار است و ما باید با مدد از روح شهدا به مقابله با آنان برویم، وفاداران مخلص نظام جمهوری اسلامی در فرصت باقیمانده تا انتخابات، تمام سعی و تلاش خود را در آگاهی بخشی به جامعه بکار گیرند تا انشاء الله در روز ۲۸ خرداد برای پیمان مجدد با شهداء با وضو در پای صندوق های رأی حاضر شویم. مرتضی نجفی قدسی از خادمان قرآن در یادداشتی با بیان این مطلب چنین نوشته است:

پیدایش وهابیت در عربستان و پدید آمدن بهائیت در ایران و ایجاد غدة سرطانی اسرائیل در فلسطین اشغالی و تلاش برای تخریب مسجد الاقصی قبلة اول مسلمانان همگی از سیاست های کهنه استعمار انگلیس و پیوست آن آمریکاست و در حقیقت این فراماسونرهای یهودی هستند که صهیونیسم جهانی ایجاد کردند و تمام هدف آنها دشمنی با اسلام است. به مناسبت فرارسیدن هشتم شوال سالروز تخریب حرم ائمه در بقیع و همچنین تلاش صهیونیست ها برای تخریب مسجد الاقصی، مرتضی نجفی قدسی یادداشتی به این شرح ارائه کرده  است: 

مرتضی نجفی قدسی طی یادداشتی درخصوص برگزاری حضوری امتحانات دانش‌آموز و خطر گسترش مجدد کرونا هشدار داد.متن این یادداشت بدین شرح است:

اگر جنایت دیروز کشتار دختران شیعه کابلی به دست داعش در اروپا رخ می‌داد در تمام اروپا یک هفته عزای عمومی اعلام می‏‌کردند و آنچنان بوق و کرنا می‏‌کردند تا تمام مردم دنیا بفهمند چه جنایتی رخ داده است، امّا چقدر شیعیان افغانستان مظلومند که حقوق بشر و سازمان ملل اینجا مرده‌اند و حتی این جنایات را به حسب ظاهر هم محکوم نمی‏‌کنند.

 مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی با عنوان «شناخت شب قدر» تأکید کرد: «قدر» به معنای تقدیر و اندازه‌گیری است و در شب قدر انسان باید علاوه بر اعمال عبادی، ساعتی به تفکر بیندیشد، بلکه هندسه وجودی خود را بشناسد و خود را ارزان نفروشد. 

یادداشتی از مرتضی نجفی قدسی :

هر دو حوزه قم و نجف هم سنتی بوده‌اند به وقتش و هم انقلابی بوده‌اند به وقتش و سعی نکنید از هر فرصتی سوء‌ استفاده کنید و بین این دو حوزه کهن که مانند دو بال برای جهان تشیع هستند، افتراق ایجاد کنید! 

روحانیت تشیع بر اساس آموزه‌های اهل بیت (ع) همیشه در مقابل ظالمان و ستمکاران و در کنار مظلومان و مستضعفان بوده‌اند و لکن شکل و چگونگی آن‏ها بر اساس مصلحت‌‏ها و تابع شرایط زمان و مکان بوده است.

در پی سخنان برخی افراد نا آگاه و یا مغرض که سعی دارند مشی حوزه‌های نجف و قم را از هم متمایز بدانند و از این رهگذر افتراقی بین جهان تشیع ایجاد کنند، مرتضی نجفی قدسی یادداشتی را به این شرح قلمی کرده است:

مرتضی نجفی قدسی از فعالان قرآنی کشور در یادداشتی به این موضوع پرداخته است که "توجه به اخلاقیات و ساختن انسان‌های مهذب و با تقوا و بیان تفسیر قرآن، دو بُعد اصلی و مهم منبرها و سخنرانی های مرحوم آیت الله ضیاء آبادی بود. وی در این یادداشت با عنوان "سیره عملی آیت الله ضیاء آبادی (ره) استاد اخلاق و تفسیر قرآن ، خاطرنشان کرد: مرحوم آیت الله ضیاء آبادی وظیفه شناس بود، برای تحصیل فقاهت به قم آمد و وقتی به قدر کفایت رسید دیگر در قم نماند و به تهران رفت و مشغول وعظ، منبر، مسجد،  تبلیغ و بیان تفسیر قرآن شد، کاری که باید همه روحانیون انجام بدهند و به قدر لازم در قم بمانند و به فکر تبلیغ دین باشند.

«مرتضی نجفی قدسی» از خادمان قرآن کریم و مؤسس دارالقرآن علامه طباطبایی خاطره‌ای شگفت از مرحوم آیت‌الله طیب، صاحب تفسیر «اطیب البیان» درایامی که امام خمینی(ره) می‌خواستند به ایران بیایند، قلمی کرده است.

در پی تخریب آلونک زن سرپرست خانواده در بندرعباس و انعکاس گسترده آن در فضای مجازی، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی انتقادی چنین نوشته است:

 یکی از شخصیت‌هایی که در دوران ما از مصادیق بارز خیراندیشی و نیکوکاری محسوب می‌شود، مرحوم حاج محمد رضا اعتمادیان بود که رهبر معظم انقلاب او را از «اخیار» نام نهادند که در بیش از چهل انجمن خیریه مشارکت فعال داشت.

مرتضی نجفی قدسی با ارسال یادداشتی  به انگیزه گرامیداشت دومین سالگرد درگذشت مرحوم حاج محمد رضا اعتمادیان  چنین نوشته است:

 استاد پرورش در عرصه تعلیم و تربیت نقش اصلی و محوری داشت و موفق شد نسلی از جوانان متخلّق و مهّذب را تحویل نظام اسلامی دهد به طوری که بسیاری از آنان به درجه رفیع شهادت رسیدند و بسیاری دیگر از خادمان انقلاب و از خدمتگزاران صالح شدند ... 

در شرایطی که در سطح کشور حدود ۶۰ فرودگاه وجود دارد و بعضی از استانها حتی چندین فرودگاه دارند، متأسفانه استان قم با وجود حجم بالای گردشگر داخلی و خارجی فاقد حتی یک فرودگاه است!

گرامیداشت یاد علامه طباطبایی از این جهت است که باید همیشه الگوها و اسوه های حسنه را به جامعه معرفی کنیم، لذا اگر ۲۰۰ سال هم بگذرد بايد یاد علامه را گرامى داشت.

حضرت آيت الله نورى همدانى در پيامى به ششمين كنگره كانون تربيت اسلامى: پيشرفت آموزش و پرورش،ارتباط مستقيمى با ارتقاء جايگاه معلم در جامعه دارد ششمين كنگره كانون تربيت اسلامى صبح امروز پنجشنبه دوم بهمن ماه از طريق فضاى مجازى در تهران برگزار شد . حضرت آيت الله نورى همدانى در اين پيام رسيدگى به امور معيشتى آموزگاران و كادر آموزش و پرورش را مورد توجه قرار دادند و از مجلس و دولت خواستند تا نسبت به احقاق حقوق معلمان و ارتقاء جايگاه والاى آنان تلاش مضاعف داشته باشند، متن كامل پيام مرجع عاليقدر حضرت آيت الله نورى همدانى به اين كنگره كه توسط مرتضى نجفى قدسى قرائت شد به اين شرح است :

بهترین توصیفات از حضرت موسی و حضرت عیسی و دیگر انبیاء علیهم‌السلام در قرآن کریم آمده است و لذا اهانت به قرآن، توهین به همه انبیاء محسوب می‌شود.
در پی اهانت مجدد به ساحت مقدس قرآن و پیامبر عظیم‌الشأن اسلام در برخی کشورهای به ظاهر متمدن اروپایی، یادداشتی توسط مرتضی نجفی قدسی از خادمان قرآن کریم قلمی شده است که در ادامه می‌آید:
بسم‌الله الرحمن الرحیم
«يُرِيدُونَ أَنْ يُطْفِئُوا نُورَ اللَّهِ بِأَفْوَاهِهِمْ وَيَأْبَى اللَّهُ إِلَّا أَنْ يُتِمَّ نُورَهُ وَلَوْ كَرِهَ الْكَافِرُونَ» (توبه، ۳۲)
می‌خواهند نور خدا را با دهان‌های خویش خاموش کنند، ولی خداوند جز این نمی‌خواهد که نور خود را به تمام و کمال رساند، هر چند کافران را خوش نیاید.

به گزارش خبرنگار قرآن و فعالیت‌های دینی خبرگزاری فارس مرتضی نجفی قدسی از پیشکسوتان قرآن و رسانه در یادداشتی ضمن تشریح موضوع مباهله و ابعاد آن، این واقعه‌ را یکی از مهم‌ترین اسناد حقانیت اهل بیت (ع) برشمرد و بر ضرورت بزرگداشت آن تأکید کرد.

مرحوم آیت‌الله بهجت در پاسخ به خبرنگاری که قصد رفتن به حوزه علمیه داشت، می‌فرمایند: ما اینجا عالم و روحانى زیاد داریم ولى امثال شما که بتوانند حرف علما را به گوش مردم برسانند خیلى کم داریم و شما که در روزنامه کار مى‌کنید ارزش کارتان از علمایى که تبلیغ مى‌کنند کمتر نیست.

ما در هیچ مسئله‏‌ای مخصوصاً در امور دینی و عبادی، اعمال و مستحبات نباید غیرعقلانی فکر کنیم. اگر پزشکان و کارشناسان بهداشت و درمان برای جلوگیری از فراگیری ویروس منحوس کرونا دستوراتی می‌‏دهند، آن را عین دستور شرعی بدانیم.

به مانند علامه طباطبایی که در میان مردان و در بین علما بی‌نظیر است، بانو امین هم در بین بانوان یک چنین جایگاهی دارد؛ لیکن نسل جدید ما چقدر به جایگاه این بانوی نمونه و اسوه آگاه است؟

مؤسس دارالقرآن علّامه طباطبایی گفت: آیت الله امینی همیشه در خط امام و رهبری معظم انقلاب حرکت می‌کرد و در اعلام مواضع نیز بسیار اصولی و عادلانه و سنجیده عمل می‌کرد.

ظهور حضرت حجت (عج) بر اساس دیدگاه قرآنی و آموزه‌های دینی نه تنها بعید نیست بلکه قریب است و ما نباید نسبت به بزرگانی که نوید ظهور را می‌دهند خرده بگیریم بلکه باید تفکر خود را اصلاح کنیم.

شب قدر وقتی قدرش درست ادا می‌شود که ما متعهد شویم قرآن و عترت را پشت سر قرار ندهیم، بلکه بالای سرمان قرار دهیم و با خدا آشتی کنیم و میهمان خوبی برای پروردگار باشیم.

یکی از رموز موفقیت آیت‌الله رسولی محلاتی در بدست آوردن این همه توفیقات در عرصه‌های مختلف دینی، علمی و تبلیغی، داشتن نظم در زندگی بود، او هیچگاه وقت خود را به بطالت نمی‌گذراند و برای هر دقیقه و ساعت برنامه منظم داشت، اُنس او با قرآن فوق‌العاده بود، شب‌ها زود استراحت می‌کرد و در عوض از نیمه شب بیدار بود.