مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی ضمن تشریح داستان جذاب مباهله و ابعاد آن، این واقعه‌ را یکی از مهم‌ترین اسناد حقانیت اهل بیت (ع) برشمرد و بر ضرورت بزرگداشت آن تأکید کرد. متن این یادداشت با توجه به اسناد تاریخی به شرح زیر است:

مرتضی نجفی قدسی واقعه غدیر را حساس‌ترین فراز تاریخی خوانده‌اند و اگر نگاهی به خطبه طولانی و چندین ساعته پیغمبر اکرم (ص) در روز عید غدیر داشته باشیم؛ به اهمیت آن واقف می‌شویم. در یادداشت ذیل به تبیین نکات و مباحثی از این خطبه پرداخته شده است.

کشور عمان که روابط مثبت و دیرینه ای با جمهوری اسلامی ایران دارد، در معرض خطر است، مخصوصاً برای اداره ی تنگه هرمز که در آبهای سرزمین ایران و عمان قرار دارد آمریکا مانع هر گونه توافق احتمالی بین ما و آنها خواهد شد و در اقدامی قریب الوقوع هزاران سربازی را که در منطقه گردآورده است را برای اشغال کشور عمان و تسلط بر سواحل جنوبی تنگه هرمز بسیج می کند تا مانع فعالیتها و کنترل نیروهای ایرانی بر این تنگه شود. در پی تهدیدات دونالد ترامپ رئیس جمهوری آمریکا بر علیه کشور عمان، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به تحلیل این ماجرا پرداخته است:

در پی شهادت مظلومانه رهبر معظم انقلاب اسلامی حضرت آیت الله خامنه ای (رض) مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به پیامدهای عظیم این شهادت پرداخته است:

مرتضى نجفى قدسى در نوشتاری به مناسب درگذشت آیت الله امام جمارانی، نوشت:

در حاشیه سخنان بسیار مهم رهبر معظم انقلاب به‌مناسبت سالگرد قیام خونین مردم تبریز در رژیم ستمشاهی و چهلم شهدا و جانباختگان کودتای آمریکایی ـ صهیونیستی دیماه، مرتضی نجفی قدسی ـ روزنامه‌نگار و مؤسس دارالقرآن علامه طباطبائی(ره) ـ در یادداشتی به تبیین فرازهایی از بیانات معظم له پرداخته است:

اگر بخواهیم جنایات رژیم پهلوی و اذنابش را بگوییم مثنوی هفتادمن کاغذ می‌شود! متأسفانه از بس نگفته‌ایم، نسل جدید کمتر از جنایات و خباثت‌های آنها می‌داند و این ضعف متوجه نظام آموزش و پرورش کشور است که چرا در تبیین واقعیت‌های تاریخی و ظلم‌هایی که توسط آمریکا و انگلیس و دست نشانده‌هایش بر ملت ایران رفته است غمض عین کرده و ما امروز شاهد شعار‌هایی در بازگشت رژیم خونخوار و جنایتکار پهلوی ولو از جانب عده‌ای قلیل هستیم! آیا حفظ نظام واجبتر از هر چیزی نیست!؟ بدانیم بقای نظام جمهوری اسلامی با اجرای عدالت و مبارزه قاطع با مفسدان اقتصادی تضمین می شود و این مهم نیز با همکاری جدی دولت، مجلس و قوه قضائیه ممکن است که امیدواریم محقق شود. در پی تلاش دشمنان در ایجاد بلوا و آشوب و سوء استفاده از اعتراضات معیشتی، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به تبیین مواضع پرداخته است.

در پی تحرکاتی با هدف تطهیر ماجرای مهدی هاشمی معدوم در برخی رسانه های خبری، مرتضی نجفی قدسی با ذکر خاطرات و بیان شواهد تاریخی، به روشنگری در این زمینه پرداخته است.

 شدت علاقه مرحوم آیت‌الله سیدمحمدعلی شیرازی به شیعیان در اقصی نقاط جهان به حدی بود که گویا پاره‌های تن خودش هستند و لذا وقتی شیخ حسن شحاته، رهبر شیعیان مصر با آن وضع ناجوانمردانه به دست سلفی‌ها در مصر به شهادت رسید و پیکر بی جانش را بر سنگفرش خیابان‌ها کشاندند، علاوه بر بیانیه بسیار مهمی در محکومیت این جنایت، تصویر این شهید را تا پایان عمر بر بالای سر خود قرار داد و بارها اشکش بر این مصیبت جاری شد. به مناسبت فرا رسیدن ۲۹ آذر ماه اولین سالگرد ارتحال عالم ربانی مرحوم آیت‌الله سیدمحمدعلی شیرازی، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به پاسداشت این عالم برجسته پرداخته است.

مرتضی نجفی قدسی در یاداشتی در خصوص موضوع" نواندیشی دینی یا انحراف فکری" آورده است: "منافقین هم ادعای اسلام شناسی داشتند، اسلامی که معجونی از اندیشه‌های التقاطی بود، آنها با روایات ائمه اطهار (ع) که مبیّن قرآن بودند، کاری نداشتند، روش آنها این بود که می‌گفتند خودتان بنشینید روی آیات فکر کنید ببینید چه برداشتی می‌کنید و نام آن را هم می‌گذاشتند برداشت‌هایی از قرآن!

مرتضی نجفی قدسی به تحلیل انحرافات فکری در لباس روحانیت و ضرورت هوشیاری حوزه‌ای پرداخته است که در ادامه مطلب می‌خوانیم:

مرتضی نجفی قدسی، فعال فرهنگی در یادداشتی به بیان نمونه‌ای از نقش فاطمیه و توسل به حضرت زهرا (س) در بین رزمندگان اسلام پرداخت.

مرتضی نجفی قدسی روزنامه‌نگار، فعال قرآنی و برگزیده خادم قرآن طی یادداشتی به مناسبت سالروز ولادت حضرت زینب سلام الله علیها نوشت:

مرتضی نجفی قدسی؛ فعال فرهنگی در ‌پی درگذشت مرحوم الهى خراسانى در یادداشتی به تبیین فعالیت‌های این محقق گرانسنگ پرداخته است که متن آن به شرح زیر است

در روزهای اخیر نرخ دلار به صورت سرسام آوری افزایش پیدا کرد و به مرز ۱۰۶ هزار تومان رسید و همین موضوع تقریباً کلیه ی فعالیت های اقتصادی خرد و کلان را تحت تأثیر قرار داده و بقولی متوقف کرده است تا مبنا و پایه ی پولی ارز مشخص شود.

محمدرضا حکیمی مجتهد، الهی‌دان، شاعر، نویسنده آثار دینی و از باورمندان مکتب تفکیک بود. مهم‌ترین اثر او مجموعه حدیثی الحیاة است که تلاش کرده است یک نظام فکری بر اساس احادیث شیعی تصویر کند. حکیمی، در عرصه سیاسی و اجتماعی، عدالت‌محور و فقرستیز بود. او حکومت دینی‌ را با معیار عدالت‌ورزی و اجرای عهدنامه مالک اشتر ارزش‌گذاری می‌کرد. از همین رو او را «فیلسوف عدالت» نامیده‌اند. 

«مرتضی نجفی قدسی» در یادداشتی، خاطره‌ای از علامه محمدرضا حکیمی در صلوات خاصه امام رضا (ع) را مطرح کرد که این یادداشت به شرح زیر می باشد: 

در پی تلاش دولت دست نشانده لبنان برای اجرای نقشه آمریکا و اسرائیل برای خلع سلاح حزب الله لبنان و آغاز مخالفتهای عظیم مردمی در این کشور، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به این موضوع و نقشه های فریبکارانه ترامپ پرداخته است:

بازديد جناب دكتر پزشكيان رئيس جمهور از مجموعه فرودگاهى در حال احداث قم خبر بسيار خوبى است، انشالله آرزوى ديرينه مردم قم و شيعيان جهان اسلام براى احداث فرودگاه بين المللى قم عليرغم تلاشهاى تنگ نظران و حسودان و مخالفان پيشرفت قم هرچه زودتر محقق شود و نفع آن به كل كشور و جهان اسلام برسد.

در پی اهانت یک مداح به حوزه ی علمیه ی قم که در حقیقت اهانت به مکتب اهل بیت (ع) محسوب می شود، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی چنین قلمی کرده است:

 در پی حمله رژیم صهیونیستی به کشورمان و با گذشت چند روز از جنگ و مشاهده آثار شکست این رژیم و طرح مجدد بحث مذاکره توسط آمریکا و فرانسه، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به بی صداقتی آمریکا و غربی ها در آمادگی برای مذاکره پرداخته است.

در پی توصیه روز گذشته رهبر معظم انقلاب به دعا کردن در روز عرفه، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به تبیین «سرزمین عرفات و درک روز عرفه» پرداخته است که متن این یاداشت به شرح زیر است: 

در پی درگذشت خادم‌الحسین(ع) مرحوم علی‌اکبر انصاری(ره)، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به توصیف خدمات او پرداخته است.

در پی قحطی گسترده در سرتاسر غزه و نایاب شدن آرد و مواد غذایی و خطر وقوع فاجعه ی انسانی، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی چنین نوشته است:

در پی همبستگی میلیونی مردم عزیز لبنان با جبهه ی مقاومت مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی با اشاره به ازدیاد ظلم و ستم رژیم صهیونیستی به ارزیابی جبهه مقاومت در منطقه پرداخته است.

به انگیزه‏ عید سعید مبعث، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به موضوع بعثت و اهداف آن پرداخته است:

مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به برخی ویژگی‌های آیت‌الله سیدمحمدعلی شیرازی پرداخته است؛ متن این یادداشت را با هم می‌خوانیم:

 در پی هشدار سازمان ملل نسبت به نسل کشی فلسطینیان بوسیله گرسنگی در نوار غزه، مرتضی نجفی قدسی به بررسی این موضوع پرداخته است:

مرتضی نجفی قدسی، در پی برگزاری نماز جمعه تهران به امامت رهبر معظم انقلاب، در یادداشتی به تبیین ابعاد این حضور شجاعانه و آگاهانه پرداخته است.

مجلس ترحیم والده ی آقای مرتضی نجفی قدسی و صبیه مرحوم آیت الله فتاح محمدی زنجانی و همسر مرحوم حجت الاسلام والمسلمین اکبر نجفی قدسی در دفتر حضرت آیت الله سبحانی برگزار شد.

به مناسبت سی امین سالگرد نسل کشی مسلمانان بوسنی و هرزگوین در اروپا مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به شباهت‌های این نسل کشی با مردم مسلمان غزه پرداخته است که در ادامه می‌خوانید:

در پى معرفى اعضاى كابينه جناب دكتر پزشكيان و حرف و حديثهايى كه پديد آمده است مرتضى نجفى قدسى در يادداشتى چنين مطرح كرده است:

به موازات گسترش حرکت شیرخوارگان حسینی در سطح جهان که اثر بسزایی در معرفی مکتب امام حسین (ع) داشته است، جبهه ی استکبار و عواملشان نیز ساکت ننشسته و به انحاء مختلف در مقابل این خیزش و جریان حسینی موضع گرفته اند.

مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به مناسبت بزرگداشت حضرت علی اصغر (ع) و شیرخوارگان حسینی، با اشاره به سابقه این جریان، چنین آورده است:

مرتضی نجفی قدسى در یادداشتی ضمن تشریح موضوع مباهله و ابعاد آن، این واقعه‌ را یکی از مهم‌ترین اسناد حقانیت اهل بیت (ع) برشمرد و بر ضرورت بزرگداشت آن تأکید کرد.

مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی در مورد چهاردهمین دوره انتخابات ریاست جمهوری نوشت:

واقعه غدیر را حساس‌ترین فراز تاریخی خوانده‌اند و اگر نگاهی به خطبه طولانی و چندین ساعته پیغمبر اکرم (ص) در روز عید غدیر داشته باشیم، به اهمیت آن واقف می‌شویم. در یادداشت ذیل مرتضی نجفی قدسی به تبیین نکات و مباحثی از این خطبه پرداخته است.

در سفر اربعین که توفیق همراهی شهید رئیسی را داشتم، یک جلد از کتاب «خاطراتی از استاد پرورش» که حاوی سی یادداشت بنده در احوالات و شرح حال مرحوم استاد پرورش وزیر آموزش و پرورش در دهه ی شصت بود را تقدیمشان کردم و ایشان پس از خواندن کتاب با شوخی به بنده گفتند: کی برای ما خاطرات می نویسی؟!» این جمله ولو به شوخی گفته شد بیانگر آن بود که ایشان در انتظار رفتن است و نمی خواهد بماند!

در این یادداشت، مرتضی نجفی قدسی در اجابت سخن ایشان،‌ خاطراتی را به شرح ذیل قلمی کرده است:

 ​در پی اظهارات یکى از نمایندگان اصفهان که هر مردی در ترکیه به طور متوسط با ۱۵ زن رابطه جنسی دارد! مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی با انتقاد از چنین اظهارات سخیف و نادرستی تأکید کرد این گزاره غلط و خلاف واقع است و طرح چنین سخنانی بسا موجب شکاف بین دو ملت بزرگ ایران و ترکیه خواهد شد! 

در پی خیزش گسترده و سرتاسری دانشجویان در آمریکا در حمایت از مردم مظلوم غزه و فلسطین، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی چنین آورده است:

در پي حرف و حديث‌هاي مربوط به حوزه علميه لاکچري اُزگل و حواشي آن، مرتضي نجفي قدسي در يادداشتي ضمن بيان اين مطالب، چنين نوشته است:

به انگیزه فرا رسیدن دهه فجر انقلاب اسلامی و سالروز ورود امام خمینی به میهن، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی چنین آورده است: 

 مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی آورده است: یکی از مسوؤلان ارشد میراث فرهنگی برایم نقل کرد که جناب آقای ضرغامی وزیر محترم میراث فرهنگی و گردشگری خیلی سخت رضایت به ثبت اماکن میراثی می دهند و آن هم به دلیل ضایع شدن حق و حقوق همسایگان آن بناهاست و ایشان نمی خواهند حقوق مردم ضایع شود. 

مانع اصلی احیای بافت‌های فرسوده چیست؟! چرا رشد نوسازی بافت فرسوده اصفهان، سالانه یک در صد است؟!

صهیونیست‌ها و داعشی ها کینه حاج قاسم را به دل دارند چرا که نگذاشت آنها به اهداف پلید خود برسند و منطقه را مورد تاخت و تاز خود قرار بدهند، حاج قاسم پناه مردم مظلوم سوریه، لبنان، فلسطین، عراق و یمن بود و سعی کرد تا با قوت خود به آنها نیرو ببخشد و در مبارزه با ظالمان و ستمگران یاریشان کند.

در پی حادثه هولناک کرمان و به شهادت رسیدن ده‌ها نفر از مردم مظلوم کشورمان، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی سوگمندانه چنین نوشته است:

زندگی مسئولان و نمایندگانی مانند چمران ها، رجایی ها و پرورش ها باید برای مسئولان کشور در همة دورانها الگو و اسوه باشد و علت اینکه ما هر سال یاد و خاطره آنها را گرامی می داریم، در حقیقت پاسداشت ارزشهای واقعی انقلاب است که امیدواریم ثمرة خون شهیدان پا برجا بماند و صالحان این امت همیشه بر مصدر امور قرار گیرند.
به انگیزة دهمین سالگرد ارتحال یار صدیق انقلاب مرحوم استاد سید علی اکبر پرورش، مرتضی نجفی قدسی یادداشتی را به شرح ذیل قلمی کرده است:

در پی وتوی قطعنامه شورای امنیت برای اجرای آتش بس در غزه توسط آمریکا، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی این موضوع را مرگ انسانیت در شورای امنیت عنوان کرده و به تحلیل این مسئله پرداخته است:

در پی تحریم انتخابات عراق از سوی جریان صدر و اختلافات پیش آمده بین شیعیان عراق، مرتضی نجفی قدسی یادداشتی را به این شرح تنظیم کرده است:

 در پی هشدار دلسوزانه حضرت آیت الله العظمی نوری همدانی نسبت به وضعیت تأسف برانگیز برخی از مساجد، مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی به تحلیل این مسئله و اشکال اصلی در اداره ی امور مساجد پرداخته است:

عملیات شجاعانه و غرور آفرین «طوفان الاقصی» در سرزمین های اشغالی فلسطین نشانگر وضعیت جدیدی در منطقه است و شکست نهایی صهیونیستها را عملی و قریب الوقوع ترسیم کرد.

مرتضی نجفی قدسی در یادداشتی تحت عنوان «راهپیمایی اربعین، گامی در خودسازی» به مناسبت اربعین حسینی چنین آورده است:

مرتضی نجفی قدسی یادداشتی را با محوریت بلاتکلیفی فرودگاه قم ارسال کرده است که متن آن را در ادامه می‌خوانید؛